但是，近年來，隨著人們生活質量的提高，加之政府對集中空調使用健康的報道，有越來越多的人開始認識到，樓宇之"肺"也會成為細菌滋生的溫床。
在我國很多大的樓宇中，已經將主機和水循環系統清洗納入預算，要求必須定期進行清洗和消毒。但是，中央空調通風管道由于遍布整座樓宇內部，且縱橫交錯，清洗起來極其困難，所以必須由專業人士進行清洗。
據美國環保機構統計，大樓疾病綜合癥中，暖氣通風裝置和空調系統，是室內助長細菌產生空氣污染的主要因素，美國每年用于室內空氣環境凈化以及員工缺勤、產量降低、利潤減少等造成很大的隱形損失，有些物業管理部門還遭到投訴和要求賠償。
目前國外許多國家都規定，建筑通風空調系統根據使用場合不同，要經常對空調系統內部進行清潔檢查。中央空調系統主宰著現代樓宇的空氣新陳代謝，是建筑物名副其實的核心“器官”。
美國環保局、丹麥技術大學等機構在美國和歐洲的調查結果表明，空調通風系統由于長期運行、清潔不當等原因，室內空氣污染來自于空調通風系統的占42%--53%，通風系統內主要污染物為顆粒物和微生物。
研究人員從中央空調通風系統內采集的樣本中發現，里面含有塵土沙礫、炭類物質、結晶體、纖維、涂料片、腐蝕掉落風管內壁材料等，此外還有一些昆蟲的尸體混雜在其中。一旦灰塵當中附著有細菌、真菌、酵母等微生物時，也就很容易使人患過敏或是呼吸疾病。
中央空調的通風系統是長期積累下來的衛生死角，其面積遠遠大于我們平時能夠清洗到的機組面積。長期得不到清潔的風管為有害物質提供了安穩的環境，它們會不斷滋生并隨著四通八達的風管在室內廣泛傳播，在空調內部造成空氣二次污染，建筑物空調通風系統所造成的人體健康危害和疾病可達幾十種。
根據其對人體的危害程度、疾病性質、致病原大致可分為兩大類:
◎急性傳染病(如軍團病)◎過敏性疾病(包括過敏性肺炎、過敏性哮喘等)
其中"軍團病(Legionellosis)",在北美、歐洲、亞洲和非洲許多國家(包括中國)都發生過，死亡率5%-30%左右。
我國早在2006年衛生部就正式實施了《公共場所集中空調通風系統衛生管理辦法》，其中明確規定，集中空調通風系統開放式冷卻塔每年清洗不少于一次;空氣過濾網、過濾器和凈化器等每六個月檢查或更換一次;空氣處理機組、表冷器、加熱(濕)器、冷凝水盤等每年清洗一次。這更體現了國家對中央空調清洗的重視和重要性。
中央空調清洗包括四個部分，分別是通風管道清洗、末端清洗、主機清洗以及水處理;通風管道和末端的清洗關乎室內空氣的質量，直接影響人們身體健康;主機清洗以及水處理清洗關系到設備的使用壽命、能耗和故障率，為保障中央空調系統正常運行最為恰當的做法是每年清洗1-2次。
